普通型流脑败血症期：病菌侵入了机体，当侵入血循环发生全身感染时称败血症。此期间患者高热、头痛、恶心、呕吐，70％的患者皮肤黏膜有瘀点或瘀斑，大小约1cm。此时患者或亲属所见到的是患者皮肤有“发青”，“发紫”的瘀点。

普通型流脑：占病例的90％。有寒战、高热、头痛、身体痛和呕吐、烦躁不安和表情呆滞等毒血症表现。2岁以下婴幼儿因颅骨缝及囟门未闭，脑膜炎症状常不典型，表现为高热、呕吐、眼睛发直、不吃奶、尖声哭叫，甚至惊厥。

脑膜脑炎型：主要表现为脑实质损害。病人表现出明显颅内压增高现象，出现频繁抽搐、意识不清、昏迷甚至出现脑疝、呼吸衰竭。