（1）该单位违反了《中华人民共和国城乡规划法》、《中华人民共和国土地管理法》、《中华人民共和国行政许可法》等。

（2）具体法规问题包括：未办理土地使用的有关文件；未取得建设用地规划许可证进行建设；未取得建设工程规划许可证进行建设，属违法建设。

（3）根据《中华人民共和国城乡规划法》的要求，首先责令其停止建设，责令建设单位就项目违法建设作出检查，说明原因。

   规划部门联合相关单位，对违法项目进行检查和违法影响评估，鉴于该建筑已经封顶，违法事实已经形成，如果可以消除对规划实施的影响（不影响相邻日照关系、周边消防、道路交通和该单位的行政办公楼），为避免国家资金损失，违法建筑收为国家所有，则该住宅可免于拆除。